不可否認，Windows在桌面領域已經取得的壟斷地位對Linux的發展有很大的制約。但Linux自身的弱點，恐怕才是更主要的原因。
第一，Linux并不是為桌面計算機訂制的。Linux在設計之初，是為了創造一個可以自由使用的Unix操作系統，而Unix系統是為大型機設計的。而大型機與微機有巨大的差別。從一個例子可以看出來：Linux支持多用戶同時登錄，這個功能在微機上根本毫無用處，因為一臺微機根本不可能兩個人同時使用。而微軟的操作系統是為微機定制的，當然更符合微機的特點，也更容易得到用戶的認可。
第二，XWindow的圖形界面體系不適合微機。XWindow層次過多，過分強調通用性，使得它不可能有很好的響應速度和穩定性。在Linux的新手中這一點尤其明顯。本來速度是Linux的一個優勢，但在相同的配置下，XWindow的速度比Windows慢了很多，而且很容易假死。這使得很多人放棄了Linux，別人問原因，回答就是“太慢。”Linux要想在桌面領域取得更大的進步，與圖形界面的結合一定要更緊密一點。
第三，Linux包涵的東西太多，啟動太慢。啟動一個Linux到桌面要比Windows多一倍的時間，這對于時間緊迫的人們來說是不可接受的。
第四，Linux沒有統一的API，開發一個好的程序太難了，編程工具也和少。一般的個人很少能寫出好的linux程序。
第五，沒有對游戲的支持。OpenGL不是為游戲設計的。如果Linux想進步。開發一個好的游戲環境勢在必行。
